Lulusan Prodi Manajemen Sumberdaya Perairan diharapkan menjadi:
- Manajer : memiliki kemampuan manajerial, terutama pada bidang manajemen sumberdaya perairan pulau-pulau kecil.
- Ilmuwan (Peneliti dan Akademisi) : mampu melanjutkan studi ke jenjang pendidikan yang lebih tinggi serta menjadi peneliti dan akademisi dalam bidang manajemen sumberdaya perairan pulau-pulau kecil.
- Tenaga Ahli Profesional : menjadi tenaga ahli profesional (konsultan, NGOs, analis lingkungan).
- Birokrat : menjadi ASN di bidang sumberdaya perairan (KKP, Kemenko Maritim, KemenLHK, DKP, Bapelitbang, DLHK).
- Wirausahawan : mampu mengembangkan usaha sendiri dalam bidang ekowisata, pariwisata alam, pelestari dan rehabilitasi lingkungan perairan.